de:software:info:pepr
Inhaltsverzeichnis
Puls-EPR
Letzte Änderungen
- v. 0.0.1 (2013-06-29)
Kriterien für das Dateiformat
- maschinenlesbar und vom Menschen lesbar („human readable“)
- Reintext (ASCII)
- eindeutige Identifizierbarkeit des Dateiformats
- durch eine Kennung in der ersten oder zweiten Zeile
Allgemeine Formatbeschreibung
Die allgemeine Formatbeschreibung befindet sich auf einer eigenen Seite.
Beschreibung der einzelnen Blöcke
Nachfolgend werden die einzelnen Blöcke einer Meta-Datei beschrieben. Ein Beispiel der Umsetzung folgt weiter unten.
Neben der Kennung gibt es aktuell folgende Blöcke:
- GENERAL
- SAMPLE
- MAGNETIC FIELD
- BRIDGE
- MICROWAVE AMPLIFIER
- VIDEO AMPLIFIER
- RECORDER
- PROBEHEAD
- TEMPERATURE
- PULSE PROGRAM
- PULSESPEL
- COMMENT
GENERAL
Der Block „GENERAL“ besteht aus einigen Grundinformationen zur Messung.
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Filename | Dateiname |
| Date | Datum |
| Time start | Uhrzeit, zu der mit der Messung begonnen wurde |
| Time end | Uhrzeit, zu der die Messung beendet wurde |
| Operator | Name der/des Messenden |
| Label | Kurze, möglichst eindeutige Bezeichnung der Messung Für die Auflistung (u.a.) in Matlab |
| Purpose | Sinn und Zweck des Experiments |
| Spectrometer | Kurze, möglichst eindeutige Bezeichnung des verwendeten Spektrometers |
| Software | Name der für die Messung verwendeten Software inkl. Versionsnummer |
| Runs | Anzahl der Durchläufe |
Anmerkungen
- Filename
- Im Falle von einer Datei pro Zeitkurve (Ox) der Dateigrundname; der eigentliche Name für die jeweilige Datei steht dann gesondert in einem eigenen Block.
- Spectrometer
- Im Falle von Fr wäre das sowas wie „Bruker EMX“
- Dieser Wert ist einer der „Schalter“, die für eine entsprechende Verarbeitung der weiteren Infodatei sorgen und die darüber entscheiden, welche (zusätzlichen) Blöcke in der Datei stehen (können).
SAMPLE
Im Block „SAMPLE“ werden die wichtigsten Informationen zur Probe zusammengefaßt.
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Name | möglichst eindeutiger und kurzer Name der Probe |
| Description | Details zur Probe |
| Buffer | Details zum verwendeten Puffer |
| Preparation | Details zur Präparation |
| Tube | verwendetes Röhrchen Hier werden sinnvollerweise Außen- und Innendurchmesser und Material angegeben |
MAGNETIC FIELD
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Start | Feld, bei dem die Messung begonnen wurde |
| Stop | Feld, bei dem die Messung beendet wurde |
| Step | Schrittweite des Magnetfelds |
| Sequence | up/down/stochastic/outward/inward |
| Controller | Typenbezeichnung der Magnetansteuerung |
| Power supply | Typenbezeichnung des Magnetnetzteils |
BRIDGE
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Model | Typenbezeichnung der verwendeten Mikrowellenbrücke |
| Attenuation | Dämpfung (in dB) |
| Power | Leistung der Mikrowelle |
| Detection | Art der Mikrowellendetektion (Diode oder Mixer) |
| Frequency counter | Typenbezeichnung des Mikrowellenzählers |
| MW frequency | Mikrowellenfrequenz |
MICROWAVE AMPLIFIER
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Type | Art des Verstärkers (z.B. TWT) |
| Model | Typenbezeichnung des verwendeten Mikrowellenverstärkers |
| Power | Leistung des Verstärkers |
VIDEO AMPLIFIER
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Bandwidth | Bandbreite des Videoverstärkers |
| Amplification | Verstärkung des Videoverstärkers |
RECORDER
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Model | Typenbezeichnung des Transientenrekorders |
| Averages | Zahl der Akkumulationen |
| Time base | Zeitbasis/Zeitauflösung (meist in ns) |
| Bandwidth | Bandbreite (meist in MHz) |
PROBEHEAD
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Type | Art des Resonators |
| Model | Typenbezeichnung |
| Coupling | Kopplung (critical/overcoupled) |
TEMPERATURE
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Temperature | Temperatur mit Einheit |
| Controller | verwendete Temperatursteuereinheit |
| Cryostat | verwendeter Kryostat |
| Cryogen | verwendetes Kühlmittel (H2O, LN2, LHe) |
PULSE PROGRAM
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung | |
|---|---|---|
| Pi-Pulse | Länge des Pi-Pulses (in ns) | |
| Sequence | Pulssequenz, z.B. „pi/2-tau-pi/2-T1-pi-T2-pi/2-tau-acq“ | |
| SRT | Schusswiederholrate (shot repetition time) in us | |
| Scans | Zahl der Programmdurchläufe | |
| AcquisitionMode | Bei Xepr sowas wie „Tables | PulseSPEL“ |
PULSESPEL
Die Felder im Einzelnen:
| Feldname | Beschreibung |
|---|---|
| Program | Bezeichnung des Programms |
| Experiment | Bezeichnung des ausgewählten Experiments |
| PhaseCycle | Gewählter Phasenzyklus |
COMMENT
Solange der Kommentar am Ende der jeweiligen Datei steht, kann hier als Freitext alles angegeben werden, was nützlich und/oder sinnvoll erscheint.
Beispiel
Nachfolgend das Beispiel einer Infodatei für trEPR-Messungen mit der vollständigen Anzahl von (möglichen) Feldern und Blöcken. Je nach Einsatzgebiet können manche Felder und/oder Blöcke wegfallen.
Weiter unten folgen dann noch spezifische Beispiele für einzelne Einsatzgebiete.
v.0.0.1
- pepr.info
pEPR Info file - v. 0.0.1 (2013-06-29) GENERAL Filename: Sample06-HYSCORE-20K-1sc-03 Date: 2013-08-30 Time start: 07:40:00 Time end: 15:17:00 Operator: Max Mustermann Experiment: HYSCORE Label: Sample 06 HYSCORE 03 Purpose: Sample 06 HYSCORE good resolution Spectrometer: Elexsys E680 Software: Xepr Runs: 1 SAMPLE Name: Bla 13CN immediately frozen Description: Bla 13CN immediately frozen (sample 06) Buffer: N/A Preparation: N/A Tube: 3,8 x 3,0 x 250 mm MAGNETIC FIELD Start: 348,30 mT Stop: 348,30 mT Step: 0 mT Sequence: none Controller: Bruker Power supply: Bruker ER 083 CS BRIDGE Model: Bruker TeraSpec Pulsed X-Band I.F. Bridge Attenuation: 05 dB Power: xx mW Detection: mixer Frequency counter: Bruker MW frequency: 9.69053 GHz MICROWAVE AMPLIFIER Type: TWT Model: Applied Systems Engineering 117X Power: 1 kW VIDEO AMPLIFIER Bandwidth: 25 MHz Amplification: 66 dB RECORDER Model: Bruker SpecJet Averages: 100 Time base: 4 ns Bandwidth: 25 MHz PROBEHEAD Type: dielectric ring Model: Bruker ER 4118X-MD5 Coupling: overcoupled TEMPERATURE Temperature: 20 K Controller: Oxford ITC 503 Cryostat: Oxford 935 Cryogen: LHe PULSE PROGRAM Pi-Pulse: 32 ns Sequence: pi/2-tau-pi/2-T1-pi-T2-pi/2-tau-acq SRT: 1000 us Scans: 4 AcquisitionMode: PulseSPEL PULSESPEL Program: HYSCORE Experiment: HYSCORE PhaseCycle: 4-step COMMENT tau = 200 ns T1 = T2 = 100:16:4196 ns pi/2 = 16 ns inversion pulse = 32 ns
v.0.0.2
- pepr.info
pEPR Info file - v. 0.0.2 (2016-06-17) GENERAL Filename: Sample06-HYSCORE-20K-1sc-03 Date start: 2014-12-01 Date end: 2014-12-01 Time start: 07:40:00 Time end: 15:17:00 Operator: Max Mustermann Label: Sample 06 HYSCORE 03 Purpose: Sample 06 HYSCORE good resolution SAMPLE Name: Bla 13CN immediately frozen ID: sa42 Batch: ba35 Description: Bla 13CN immediately frozen (sample 06) Solvent: N/A Substrate: N/A Preparation: N/A Tube: 3,8 x 3,0 x 250 mm EXPERIMENT Type: 2PFSE|InvRec|ESEEM|HYSCORE|ENDOR Runs: 1 Variable parameter: attenuation|temperature|... Increment: xxx SPECTROMETER Model: Bruker Elexsys E580 Software: Xepr 2.6b.131 MAGNETIC FIELD Field probe type: Hall Field probe model: xxx Start: 348,30 mT Stop: 348,30 mT Step: 0 mT Sequence: none Controller: Bruker Power supply: Bruker ER 083 CS BRIDGE Model: Bruker TeraSpec Pulsed X-Band I.F. Bridge Controller: Bruker MBC Attenuation: 05 dB Power: xx mW Detection: mixer Frequency counter: Bruker MW frequency: 9.69053 GHz MICROWAVE AMPLIFIER Type: TWT Model: Applied Systems Engineering 117X Power: 1 kW VIDEO AMPLIFIER Bandwidth: 25 MHz Amplification: 66 dB RECORDER Model: Bruker SpecJet Averages: 100 Time base: 4 ns Bandwidth: 25 MHz ENDOR RFAmplifier: Amplifier Research 250A250A RFStart: 50 MHz RFStop: 66 MHz RFStep: 16/320 MHz Attenuation: 0 dB SumAttenuation: 11 dB Mode: stochastic PROBEHEAD Type: dielectric ring Model: Bruker ER 4118X-MD5 Coupling: overcoupled TEMPERATURE Temperature: 20 K Controller: Oxford ITC 503 Cryostat: Oxford 935 Cryogen: LHe PULSE PROGRAM SRT: 1000 us Scans: 4 AcquisitionMode: PulseSPEL PULSE PATTERNS Channel Name: +x Position: 0,100 Length: 18,36 PositionDisplacement: 0 LengthIncrement: 0 Channel Name: Acq Position: 230 Length: 66 PositionDisplacement: 0 LengthIncrement: 0 PULSESPEL Program: HYSCORE Experiment: HYSCORE PhaseCycle: 4-step COMMENT tau = 200 ns T1 = T2 = 100:16:4196 ns pi/2 = 16 ns inversion pulse = 32 ns
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