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Problemstellung, Herausforderungen und Anforderungen

Konzept und Umsetzung: labinformeln

Anwendung auf die eigene Praxis

Vorteile gegenüber Alternativen

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Glossar

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• Ein Laborbuch dient primär der Protokollierung
  der Datenerhebung und der Dokumentation erster Ergebnisse.
• Struktur(ierung) ist essentiell für die Nachnutzbarkeit.
  Stuktur ist wichtiger für Informationen als Digitalität.
• ELNs dienen nicht der Ablage oder Verarbeitung von Daten.
  Schnittstellen ermöglichen aber die Informationsweitergabe.
• Es gibt nicht das eine ELN für alle Anwendungsfälle.
  ELNs müssen immer an die Abläufe angepasst werden.
• Interoperabilität zwischen ELNs ist ein Wunschtraum.
  Entscheidend sind Struktur und robuste Exportformate.

Diese Fragen dienen der persönlichen Beschäftigung mit der Thematik, werden aber nicht separat in der Vorlesung besprochen.

• …

Zu LabInform ELN gibt es eine Demoinstanz:

• https://eln.labinform.de

Die Dokumentation ist ebenfalls online verfügbar:

• https://eln.docs.labinform.de/

Und der Preprint, der das ELN beschreibt, findet sich auf ChemRxiv:

• https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2023-2tvct

Eine kommentierte und handverlesene Liste mit weiterführender Literatur zum Thema. Die Auswahl ist zwangsläufig subjektiv.

Der Preprint zum LabInform ELN ist [Schröder, 2023Schröder, Mirjam; Biskup, Till (2023): LabInform ELN: A lightweight and flexible electronic laboratory notebook for academic research based on the open-source software DokuWiki, ChemRxiv 2023:1-14]. Ansonsten wären hier natürlich die einschlägigen Laborbücher (u.a. Chemotion [Tremouilhac, 2017Tremouilhac, Pierre; Nguyen, An; Huang, Yu‐Chieh; Kotov, Serhii; Lütjohann, Dominic Sebastian; Hübsch, Florian; Jung, Nicole; Bräse, Stefan (2017): Chemotion ELN: an Open Source electronic lab notebook for chemists in academia, J. Cheminf. 9:54], elabFTW [CARPi, 2017CARPi, Nicolas; Minges, Alexander; Piel, Matthieu (2017): eLabFTW: An open source laboratory notebook for research labs, J. Open Source Software 2:146], openBIS [Barillari, 2016Barillari, Caterina; Ottoz, Diana S. M.; Fuentes-Serna, Juan Mariano; Ramakrishnan, Chandrasekhar; Rinn, Bernd; Rudolf, Fabian (2016): openBIS ELN-LIMS: an open-source database for academic laboratories, Bioinformatics 32:638-640]) und die relevante Metaliteratur [Kanza, 2017Kanza, Samantha; Willoughby, Cerys; Gibbins, Nicholas; Whitby, Richard; Frey, Jeremy Graham; Zupančič, Jana Erjavec AN Klemen; Hren, Matjaž; Kovač, Katarina (2017): Electronic lab notebooks: can they replace paper?, J. Cheminf. 9:31, Bird, 2013Bird, Colin L.; Willoughby, Cerys; Frey, Jeremy G. (2013): Laboratory notebooks in the digital era: the role of ELNs in record keeping for chemistry and other sciences, Chem. Soc. Rev. 42:8157-8175, Higgins, 2022Higgins, Stuart G.; Nogiwa-Valdez, Akemi A.; Stevens, Molly M. (2022): Considerations for implementing electronic laboratory notebooks in an academic research environment, Nat. Protoc. 17:179-189, Kanare, 1985Kanare, Howard M. (1985): Writing the Laboratory Notebook, American Chemical Society, Washington, D.C.] zu zitieren.

Da Laborbücher ein essentieller Teil des scientific recordkeeping sind, siehe auch hier z.B. [Shankar, 2007Shankar, Kalpana (2007): Order from chaos: The poetics and pragmatics of scientific recordkeeping, J. Am. Soc. Inf. Sci. Technol. 58:1457-1466, Ebel, 2004Ebel, Hans F.; Bliefert, Claus; Russey, William E. (2004): The Art of Scientific Writing, Wiley-VCH, Weinheim].

• Barillari, Caterina; Ottoz, Diana S. M.; Fuentes-Serna, Juan Mariano; Ramakrishnan, Chandrasekhar; Rinn, Bernd; Rudolf, Fabian (2016): openBIS ELN-LIMS: an open-source database for academic laboratories, Bioinformatics 32:638-640
• Bird, Colin L.; Willoughby, Cerys; Frey, Jeremy G. (2013): Laboratory notebooks in the digital era: the role of ELNs in record keeping for chemistry and other sciences, Chem. Soc. Rev. 42:8157-8175
• CARPi, Nicolas; Minges, Alexander; Piel, Matthieu (2017): eLabFTW: An open source laboratory notebook for research labs, J. Open Source Software 2:146
• Ebel, Hans F.; Bliefert, Claus; Russey, William E. (2004): The Art of Scientific Writing, Wiley-VCH, Weinheim
• Higgins, Stuart G.; Nogiwa-Valdez, Akemi A.; Stevens, Molly M. (2022): Considerations for implementing electronic laboratory notebooks in an academic research environment, Nat. Protoc. 17:179-189
• Kanare, Howard M. (1985): Writing the Laboratory Notebook, American Chemical Society, Washington, D.C.
• Kanza, Samantha; Willoughby, Cerys; Gibbins, Nicholas; Whitby, Richard; Frey, Jeremy Graham; Zupančič, Jana Erjavec AN Klemen; Hren, Matjaž; Kovač, Katarina (2017): Electronic lab notebooks: can they replace paper?, J. Cheminf. 9:31
• Schröder, Mirjam; Biskup, Till (2023): LabInform ELN: A lightweight and flexible electronic laboratory notebook for academic research based on the open-source software DokuWiki, ChemRxiv 2023:1-14
• Shankar, Kalpana (2007): Order from chaos: The poetics and pragmatics of scientific recordkeeping, J. Am. Soc. Inf. Sci. Technol. 58:1457-1466
• Tremouilhac, Pierre; Nguyen, An; Huang, Yu‐Chieh; Kotov, Serhii; Lütjohann, Dominic Sebastian; Hübsch, Florian; Jung, Nicole; Bräse, Stefan (2017): Chemotion ELN: an Open Source electronic lab notebook for chemists in academia, J. Cheminf. 9:54