Die Ursprünge der trEPR-Toolbox reichen zurück in den Spätsommer und Herbst 2005, als der Autor mit seiner Doktorarbeit begann und vor der Notwendigkeit stand, die aufgenommenen Spektren auszuwerten.
Erste Ideen zu einer graphischen Benutzeroberfläche (GUI) kamen vermutlich um das Jahr 2007 auf. Richtig ernst damit wurde es aber erst im Herbst des Jahres 2009, als die Toolbox als solche schon klare Gestalt angenommen hatte und es sich herausstellte, daß der Nutzerkreis dieser Toolbox weiter wuchs und damit ein einfacher Zugang zu ihren Funktionen eine gewisse Priorität bekam.
Ein paar Screenshots der GUI aus dem Jahr 2010 vermitteln einen guten Eindruck, wie weit das Projekt bis dahin gediehen war. Ebenfalls aus historischen Gründen gibt es auch noch die einführenden „Ersten Schritte“ mit der alten GUI.
Seit dem Frühjahr 2011 gab es dann aus unterschiedlichen Gründen einen neuen Anlauf, diesmal sowohl die GUI als auch die gesamte Toolbox neu zu ordnen und den über die Jahre gewachsenen Code auf eine deutlich einheitlichere Basis zu stellen.