29. Datenformate: beständig und plattformunabhängig

Themen
Kriterien für Datenformate in der Wissenschaft
Beispiele plattform- und sprachunabhängiger Formate
Zum Umgang mit Daten und Metadaten
Bedeutung im Gesamtkontext einer Auswertungssoftware
Folien
PDF


Zentrale Aspekte

Weiterführende Literatur

Eine kommentierte und handverlesene Liste mit weiterführender Literatur zum Thema. Die Auswahl ist zwangsläufig subjektiv.

Viele Autoren, die sich mit Datenformaten beschäftigen, liefern ein Plädoyer für die Nutzung von reinem Text für die Datenablage und Kommunikation. Vgl. dazu Kapitel 3 in [Hunt, 1999Hunt, Andrew; Thomas, David (1999): The Pragmatic Programmer, Addison-Wesley, Boston], Kapitel 8 in [Kernighan, 1999Kernighan, Brian W.; Pike, Rob (1999): The Practice of Programming, Addison Wesley, Boston] und Kapitel 5 in [Raymond, 2004Raymond, Eric S. (2004): The Art of UNIX Programming, Addison Wesley, Boston]. Letzterer liefert darüber hinaus viele sehr gute (und praxisrelevante) Hinweise zur Erstellung eigener textbasierter Formate und diskutiert diverse bekannte Textformate wie DSV/CSV, XML, Windows-INI-Dateien etc.

Eine sehr kurze Einführung in HDF5 aus der Sicht der Experimentalphysik einerseits und Python andererseits liefert Kapitel 9 in [Scopatz, 2015Scopatz, Anthony; Huff, Kathryn D. (2015): Effective Computation in Physics, O'Reilly, Sebastopol]. Spezifisch für HDF5 und seine Verwendung in einem Python-Kontext ist [Collette, 2014Collette, Andrew (2014): Python and HDF5, O'Reilly, Sebastopol].

Eine prägnante Darstellung der Aspekte, die man beim Umgang mit Daten in den Naturwissenschaften beachten sollte, egal ob in der Biologie und Bioinformatik oder ob in der Teilchen- oder Astrophysik, liefert [Hart, 2016Hart, Edmund M.; Barmby, Pauline; LeBauer, David; Michonneau, François; Mount, Sarah; Mulrooney, Patrick; Poisot, Timothée; Woo, Kara H.; Zimmerman, Naupaka B.; Hollister, Jeffrey W. (2016): Ten simple rules for digital data storage, PLoS Computational Biology 12:e1005097].